بررسی فنوتیپی و ژنوتیپی انواع باکتری های halomonas sp. دریاچه ارومیه

دریاچهارومیهبهعنواندومیندریاچهشوردنیاویکیازمعدوددریاچههایفوقاشباعدائمیدرجهان،دارایتنوعزیستیوسیعیازانواعمیکروارگانیسمهایهالوفیلوهالوتولرنتاست. دراینپژوهشاعضاییازجنسhalomonasکهشاملباکتریهایهالوفیلنسبیمیباشند،ازدریاچهارومیه پس از جداسازیموردبررسیهایفنوتیپیوژنوتیپیقرارگرفتند.نمونههاازمناطقمختلفدریاچهارومیهجمعآوریودرشرایطاستریلبهآزمایشگاهمنتقلشدند. سپسبرایجداسازیازمحیطهای alkaline peptone water (apw)، nutrient broth (nb)، nutrient agar (na)، macconkey agar (mac)همراهبا 5 و 10درصد  نمکاستفادهشد. کشتهایمربوطهبهمدت 48-24 ساعتدردمای 37-35 درجهسانتی گرادگرماگذاریشدند.برایدستیابیبهکلنیهایخالص،کشتهایمتوالیصورتگرفت. درنهایت 80 سویهبهدستآمد.اینسویه هابراساسویژگیهایمورفولوژیکو فنوتیپیموردمطالعهقرارگرفتند. همچنینتست هایتشخیصیوبیوشیمیاییوتستتحملنمکیبررویسویه هایجداسازیشدهانجامشد. جهتانجاممطالعاتژنوتیپیوبررسی هایفیلوژنتیکی، 15 سویهبرایآزمونژنتیکیبرپایهsequencing 16s rrnaانتخابشدند.برایاینمنظورdnaژنومیباکتریهایمنتخباستخراجوتوسطتکنیکpcr  تکثیرشدهونتایجحاصلازsequencing 16s rrnaتوسطنرمافزارهایمربوطهویرایشوتشابهتوالیاینسویههادرمقایسهباانواعثبتشدهدربانکژنیپایگاهاطلاعاتیeztaxon  آنالیزشد. 6 سویهمتعلقبهhalomonasبودندکهدرختفیلوژنتیکیآنهابهروش neighbour-joining  رسمگردید.اینسویههاازنظرفیلوژنتیکمتعلقبهگونههای halomonas janggokensis, halomonas gomseomensis, halomonas boliviensis, halomonas andesensisبودند. میزانتشابهبرای halomonas janggokensisوhalomonas gomseomensis  بیشاز 99درصد بود. برایhalomonas boliviensisونیزنیمیاز  halomonas andesensis  جداسازیشده، تشابهبین 9/98- 97درصد نشاندادهشد. نیمدیگرازhalomonas andesensisتشابه 2/94 درصد رابانزدیکترینسویههایثبتشدهدرژنبانکداشتند. باانجاممطالعاتتکمیلیمانندهیبریداسیونdna-dnaوتعیینمحتوای g+cو ... ، اینسویههاممکناستدرگونههایجدیدیقرارگرفتهونمایندگانیازسویههایبومیدریاچهارومیهباشند.